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梁著系列中，清代系列作品共十七部，占梁著之一半，而“抗清”这个主题可以说是贯穿了这个系列的始终，本文试根据各部作品年代的先后将整个抗清斗争作一个简单整理，以形成一条不太连贯的脉络，从中找出整个系列的某些特点。
特别强调，梁著系列所叙述的抗清斗争是一个演义，羽生先生不认为这是“正史”，书中多处强调是“小说家言”，而本人及绝大多数读者也从未当“正史”读，阅读梁著的抗清史同“正史”进行比较不失为某种乐趣，但若是打着正史的旗号作出“义愤填膺”状，进而攻击作者则大可不必。同样本文只是叙述演义故事，不涉及民族问题，这方面的话题也请不要展开。
由于时间仓促，疏漏、错误之处应是很多，希望家园的朋友指出，一同完善。
顺治年间
公元1644年，明崇祯17年，清顺治元年，顺永昌元年，李自成率军攻破北京城，崇祯皇帝上吊于煤山，4月，吴三桂开关迎多尔衮清军入关，清八旗军同吴三桂军联手在一片石击败李自成军，五月一日，清军进占京师。多尔衮奏请六岁的清顺治帝（清世祖）爱新觉罗福临迁都京师。同年九月，顺治帝从盛京迁都京师，“定鼎燕京”。吴三桂受清封平西王，又为清军先锋，追击李自成部，李自成在清兵和吴三桂夹击之下，在湖北九宫山战死，吴三桂等后又灭四川张献忠大西政权。清军趁胜挥师南下，先后消灭了弘光政权、隆武政权、鲁王监国、绍武政权及永历政权，开始了满清在中国268年的统治。
满清统治期间，汉人及其它民族人民由于不堪忍受满清贵族的残酷统治和压迫，奋起反抗，写下了多少可歌可泣的诗篇。
顺治入关后的第七年，中原的大局已定，清廷一面继续对南明政权、大顺、大西义军残部用兵，另一面开始入军西北，引起新疆各族，奋起抵抗作战。清军以伊犁为中心，由将军纳兰秀吉统领，不断向各族用兵，迫使各族顺从清的统治。而新疆则以哈萨克族和罗布族反抗最为激烈，尤以罗布族在首领唐努和女儿“飞红巾”的带领下，对清军进行英勇抗争，多次予清军以重创。由于回疆幅员广大，加之清军进兵不久，双方互有胜负。
天山之上，隐居着三名高人。有原明辽东经略使熊廷弼之参赞岳鸣柯，蒙冤远走天山出家，号晦明禅师，有因爱而一夜白发的白发魔女练霓裳，有前武当掌门卓一航。晦明禅师有徒杨云骢、楚昭南，白发魔女有徒飞红巾，卓一航有徒辛龙子，皆已艺成。
天山剑客杨云骢艺成下山，加入到哈萨克族的反清队伍中，哈萨克族的族人骁勇善战，著名的战士有伊士达、麦盖提，到天山剑客杨云骢的相助，也予清军以重大打击。双方在长达六年的斗争中，哈萨克一方终因寡不敌众，自新疆中部一直退至南疆。
顺治十三年，哈萨克族抵抗战士被迫进了塔克拉马干大沙漠。各部分成了零星小股，四处逃散。
罗布族同清军长期交战，清军先是诱降了罗布族阵营中，杨云骢的师弟楚昭南，后又在在久攻未果之下，收买了罗布族著名歌手，也即是飞红巾恋人押不卢，押不卢出卖了唐努的驻地，致唐努老英雄战死。而后押不卢出逃，被飞红巾俘获。
杨云骢一行在大沙漠中遇到清廷高手钮祜庐和已叛变投敌和师弟楚昭南所截杀，又遇大风沙，杨云骢与同伴失散，九死一生中，在离伊犁四面余里的扎木台为纳兰秀吉之女纳兰明慧所救，双方互有好感，初种情苗。
杨云骢在逃离纳兰秀吉驻地途中，遇到俘获了押不卢的飞红巾，双方一见如故，杨云骢助其击退清军高手的侵扰，又抓住了楚昭南，但不久楚昭南逃脱。
杨云骢陪同飞红巾走过南疆的“铁门关”，穿过孔雀河，来到罗布族领取的草原中。在证据确凿之下，飞红巾亲手处死了押不卢，祭奠唐努老英雄。飞红巾又通过比武，折服南疆各族勇士，成为南疆三族十四部落的新盟主。杨云骢也决意留下协助飞红巾抗敌。
南疆各族同清军的战争继续进行，在一次遭遇战中，南疆各族先胜后败，杨云骢同飞红巾等失散。乱军中杨云骢救下了被俘的纳兰明慧，双方爱意进一步加深，杨云骢将纳兰明慧护送至伊犁，为打探队伍和飞红巾消息，也为了纳兰明慧，杨云骢被迫暗自藏在纳兰秀吉府中。这时满清亲王多铎到伊犁巡阅，并向纳兰秀吉提亲。
纳兰明慧在无法拒绝多铎求亲之下，同杨云骢发生了关系。杨云骢踪迹被钮祜庐发现后，救出被清军俘获的麦盖提，逃出将军府，一番波折，到了南疆哈萨克族的驻地到了喀尔沁草原，同飞红巾等再度会合。
喀达尔族的酋长孟禄诬陷杨云骢为奸细，杨云骢为表明心迹，同飞红巾一道活捉了楚昭南，救回了哈萨克酋长的儿子，但不久楚昭南被卓一航之徒辛龙子所救。飞红巾知道杨云骢同纳兰明慧关系后，伤心欲绝，率族人离开。战机一触即发，杨云骢继续帮忙哈萨克的酋长策划对抗清军，帮助哈萨克的老酋长将楚昭南打得大败，把附近清军的城堡也占据了。期间纳兰明慧暗中在草原产下一女，杨云骢得知消息后，冒险回到伊犁城中，想见纳兰明慧一面，甫一见面，即遭遇为清军招揽的天龙派高手天蒙上人及其派中弟子，杨云骢在破了天龙剑阵后离去。
杨云骢替卓一航送信至天山，却意外见到伤心白发的飞红巾，苦劝无果后黯然独自下山。这时纳兰秀吉已调任杭州总兵。关内多铎平定了前明鲁王的遗部，又承袭了鄂亲王的王位，期间南疆草原上的抗清武装，受到极大的打击。北疆的清兵在统治巩固之后，调兵南来，而多铎也请准皇上，把青海驻屯军的骑兵都调到新疆。而另一方面，喀尔沁草原上，自飞红巾率部离去后，实力也较前单薄。竟给清军各个击破了。杨云骢千辛万苦，在草原上找到了他的两个盟兄弟，伊士达和麦盖提。
杨云骢再度潜回伊犁，却发现纳兰明慧已离开新疆，前往杭州，多铎和纳兰明慧的婚期已定了在八月十八举行。杨云骢进入关内，打算在见明慧一面后，联络关内的反清力量，共图大计。此时为清顺治十四年之八月。中原处南明永历政权李定国部据云南，李闯王儿子李锦的大军占据湖北、四川交界的山林，郑成功部据闽粤，继续对清的抗争。清封三藩，吴三桂封平西王，镇守云南，兼辖贵州；尚可喜封平南王，镇守广东；耿仲明封靖南王。
杭州城中，多铎所清军抓得鲁王旧部中一少年梁穆郎，几番刑讯迫供未果，用苦肉计诱使梁穆郎说出队伍所在地，之后多铎率军对鲁王的残余队伍加以剿杀，鲁王旧部伤亡严重。
公元1657年八月十八（顺治十四年），杨云骢至杭州将军府，抢走了同明慧所生之女，这时鲁王旧部也乘多铎婚礼之机，组织劫狱，救走了很多被捕之人。杨云骢至郊外江边时，遇到了清廷高手钮祜庐，双方交手，两败俱亡，杨云骢将女儿托付被女友刘郁芳误解的梁穆郎，惨死于钱塘江边，而刘郁芳这时也知误解于梁穆郎，但却发现在江面上飘着一件长衫，沙滩上有两只鞋子。
之后数年，梁穆郎携杨云骢之女上天山，梁穆郎更名凌未风，拜在晦明禅师门下学艺，杨之女取名易兰珠，由凌抚养成人。
期间，关内抗清力量不断挫败，清军平定中原之后，兴兵三路，大举进攻李定国，洪承畴、吴三桂等大汉奸都是满军的前驱，而张献忠余部的另一股主师孙可望忽然在阵前叛变，投降了满清。李定国一路败退，直给退到缅甸，在孟腊吐血而亡，李定国临终时，将以黄金十万八千斤，铸成十八罗汉，藏于剑阁山洞中，由部下大将桂天澜守护，留作抗清之资。李锦战死后，其部属由其养子李来亨率领。继续潜伏于川滇交界山林中，伺机出击。郑成功在攻占台湾后次年病亡。鲁王旧部继续潜伏，伺机报仇，直接目标对准剿杀鲁王政权及部众的亲王多铎，这时多铎已同纳兰明慧成婚，居于北京。楚昭南则为吴三桂所延揽，为军中总教头，镇压抗清力量，成了抗清义士眼中可怕的魔头。
康熙年间
顺治皇帝由于宠妃董小苑被太后所杀，伤心欲绝，至五台山出家，清廷对外称得天花身亡。其子玄烨继位，年号康熙。数年后凌未风艺成下山，在西北地区继续同清军作战，得到了“天山神芒”之称号，易兰珠也已艺成下山。
清康熙十三年，控制大权的康熙皇帝开始部署“削藩”，引起吴三桂等“三藩”之恐慌，密谋反清。吴三桂一面着手反清各项准备，一面派出心腹大将楚昭南，联络西藏喇嘛，不料楚昭南料定吴三桂将会兵败，准备背叛吴三桂，投靠康熙。鲁王旧部拥立刘郁芳为首领，重要成员包括常英、程通、通明和尚，以及反清义士张煌言之子张华昭，鲁王旧部密谋趁多铎陪伴康熙五台山进香之机，暗杀多铎。西北一马场场主韩志邦成立天地会，矢志抗清。
康熙十三年，清凉寺文殊菩萨的开光大典，鲁王旧部在刘郁芳带领下，在五台山上部署刺杀鄂亲王多铎，同时，艺成下山的易兰珠也同时向多铎挥起复仇之剑，武林高士傅青主携冒辟疆、董小宛之女冒浣莲相助刘郁芳，在行将得手之际，由于意图背叛吴三桂的楚昭南出手，楚昭南同傅青主一战，不分胜负。多铎援军赶到，刺杀行动功亏一篑，张华昭失陷，退至山下终南名宿武元英庄中。
楚昭南意图加害西藏喇嘛，被凌未风所阻，韩志邦赶至武元英庄中，刘郁芳部同韩志邦天地会合并，刘郁芳任总舵主。傅青主同冒浣莲夜探清凉寺，楚昭南向康熙出卖吴三桂。傅青主发现了在清凉寺出家的顺治帝，在顺治帝的干涉下，傅青主、冒浣莲得以离去，张华昭为纳兰容若所救。康熙恐皇家秘密外泄，密令卫士阎中天杀害顺治，而后杀人灭口，阎为凌未风所救，带至武元英庄中。
凌未风带同阎中天至武元英庄同刘郁芳、韩志邦会合，并告知吴三桂行将反清的消息。这时多铎命手下大将张承斌搜捕刘郁芳部，至武元英庄外，形势危急，得阎中天解围，阎却在解围后毒发身亡。武元英庄已暴露，群雄商议，决定弃庄远走，武家父女和一众庄丁，随华紫山、杨一维二人留在山西，主持西北的天地会；刘郁芳和韩志邦入云南，看吴三桂的情形，利用他和清廷的冲突，图谋复国；傅青主和冒浣莲入川，去看四川的形势；通明和尚和常英、程通赴粤，去截清廷的人，至于易兰珠，则自愿孤身进杀，设法救张华昭。
凌未风、刘郁芳、韩志邦，绕道西行入滇，至山西大同云岗石窟，遇康熙派楚昭南拦劫吴三桂部下护送“舍利子”（吴三桂追桂王入缅，把缅甸紫光寺镇寺之宝──龙树禅师留下的“舍利子”劫了回来）入藏的张天蒙。凌未风等助西藏喇嘛卫护舍利子，凌未风击败楚昭南，但舍利子仍被负伤的张天蒙带离。
吴三桂差遣使者带信到川滇边区，致函李来亨，要求弃嫌修好。李自成之孙、李来亨之弟李思永（即李赤心）提出“以我为主，先外后内”之方略，并亲自到昆明，同吴三桂进行谈判。
韩志邦因误会负气离去，却意外得到武林失传的“达摩秘笈”，并夺回舍利子，交予西藏喇嘛，后随喇嘛入藏。凌未风和刘郁芳赶至距离昆明只有三百多里华宁时，遇清廷高手也是凌未风仇人的邱东洛截击平南王尚之信派吴三桂使者金崖，邱另一任务是传达清廷密诏，给驻昆明的安西将军李本深，叫他会同云南巡抚朱国治密谋把吴三桂除掉的。凌未风、刘郁芳在李思永相助下，击败邱东洛及大内高手，截得密诏。
李思永、凌未风、刘郁芳等同吴三桂的谈判由于分歧大而无法进行，但是筵席间凌末风等还是告知了吴三桂有关清廷的密令。鉴于谈判不成，吴三桂设计扣押李思永等于水牢中，意图胁迫李来亨带兵为其打头阵，但凌末风等人没有屈服。幸得傅青主率众相救，凌未风等化险为夷，此役诛杀吴三桂心腹大将保柱。
傅青主、冒浣莲前番入川在剑阁目睹了石天成、桂天澜因误会而发生的争斗，又遇清廷卫士抓捕桂天澜，相救未果后遵桂临终所嘱至滇东“五龙帮”救下黄衫少年桂仲明。
大闹平西王府之役后，李思永估计吴三桂的反清即将发动，因此在脱险之后的第二天，就率众返回防地。傅青主、刘郁芳等也接受了李思永的邀请，到他军中暂住。凌未风、冒浣莲和黄衫少年至剑阁寻回桂仲明的记忆。
吴三桂发布檄文起兵反清，吴三桂联络王辅臣在西北起兵，尚之信、耿精忠又在南方遥为呼应，吴三桂亲自率领大兵，攻出湖北，想沿江而下，攻占全国心脏。对此李思永定下的策略是：趁这个时机，扩大反清。和吴三桂各干各的，一面保持川滇边区，一面发动各处英豪，揭竿起义。同时积极开展营救张华昭行动，以便到内地号召张煌言之旧部，在江南作桴鼓之应。
凌未风、冒浣莲在剑阁帮桂仲明寻回记忆，又打败了以王刚为首的大内卫士。之后更是力败群雄，取出李定国遗下的黄金，并为李来亨军中延揽了如韩荆、朱天木等高手，随后傅青主凌未风带领群豪，投到李来亨军中，石天成夫妻和徒弟于中、女儿竹君与及张青原则留在谷中，守卫藏金，等候搬运。桂仲明和冒浣莲随他们出了剑阁之后，径往京师襄助营救张华昭。
桂仲明、冒浣莲抵达京师后，会同早往京师的易兰珠，在蹑云剑石振飞和纳兰容若的帮助下，救出了张华昭，期间桂仲明、易兰珠同楚昭南有过数次交手。但是整个抗清形势未有好转，鲁王在江湖的旧部，趁三藩之变，浮起头来，竟给清廷大军，打得七零八落，江南起义，已是不能。而清廷同三藩之战也朝有利于清廷一方转化，这时清廷派出鄂亲王多铎为征西统帅，率领八旗精锐，就将开赴西南，消灭吴三桂和李来亨。李来亨提出派出刺客，在多铎出京前，将其刺杀，面对国恨家仇，易兰珠慨然承担这一重任。
易兰珠会同天地会，经过苦心筹划，终在多铎出京前在西山将其刺杀，但易兰珠也落入敌手。由于纳兰明慧托病拖延“审理”，易兰珠暂未被处决。群雄积极开展营救易兰珠的行动，凌未风、飞红巾、韩志邦都来到京师，痴恋张华昭的三公主盗出朱果金符，飞红巾夜闯王府，凌未风劫天牢，而清廷方面也加强守卫力量，除楚昭南外，内廷侍卫中的第一高手成天挺以及不久前下山的风雷齐真君都是绝顶高手，双方围绕营救与反营救开展激烈的厮杀，营救行动受阻。为救爱女纳兰明慧自尽身亡。在易兰珠被押赴刑场途中，凌未风一方任何西藏活佛的“车仗”掩护以及众人齐心协力，营救行动成功，易兰珠被飞红巾带上天山。
此后数月，吴三桂日暮途穷，在衡阳开府称帝，满清大军因此加紧进袭，吴三桂不久病亡，三藩终被平定。随着吴三桂的挫败，满清在四川却有了意外的收获，清军配合了吴三桂的叛军，竟把川滇边区李来亨的部队击破了，李来亨因陷入重围，不肯投降，自缢而死。他的弟弟李思永逃亡。清廷一面加紧围捕李思永，另一面在各省选拔武土，并整顿大军，意图攻略新疆西藏之意。
凌未风、张华昭、冒浣莲和桂仲明北上天山，寻找易兰珠，途中又同卓一航之徒步辛龙子交手。四人抵天山的次日，晦明禅师在传授武学，交待上一辈的恩怨情仇后，于第二日圆寂。凌未风等四人再上天山南高峰，历经一番波折。最终易兰珠悄然下山，更令飞红巾焕发当年的英姿神采，慨然下山，同族人并肩作战。飞红巾在天山南北的传奇经历，这番下山，更为激起了各族的反清斗志。
先行下山的易兰珠同白发魔女的另一徒弟武琼瑶在新疆著名的“火洲”吐鲁蕃中救下了逃亡的李思永，这时武元英集合西北各地入疆的天地会友，为李思永布置一个落足之点，准备重创基业。但是清廷卫士也转眼杀至，楚昭南诱骗辛龙子共同对付反清义侠，一番厮杀，清廷卫士退走，但是韩荆战死。楚昭南意图加害辛龙子，谋取达摩秘笈，未能得手，辛龙子被凌未风所救，初步化解了仇恨。
而清廷在加紧对付以李思永为首的汉族反清力量的同时以齐真君任大内侍卫的首领，而以成天挺副之。楚昭南则仍然做禁卫军的统领。大举进兵新疆蒙藏。进军后派齐真君做特使，收服南疆达喀尔族的酋长孟禄，孟禄和另外三个部落归顺了清廷。随后孟禄聚集一向听他话的三族十二部落的酋长会谈，其中却有七个部落不愿投顺，杨云骢的好友伊士达斥责孟禄，遭其杀害。
清廷又派出高手袭击武元英在西北的庄子，打伤武元英。好在凌未风等及时赶到，围歼了清廷派出的铁扇帮主尚云亭和人妖郝飞凤，击败了天蒙禅师。利用此役凌未风收服了辛龙子，反清力量更添臂助。
飞红巾下山后，各族归心。只余达喀尔族的酋长孟禄，凌未风、辛龙子到喀尔沁草原的酋长大会上，击败清廷使者天雄上人，迫使孟禄退位，由其女孟丽丝为酋长，南疆各部形成以飞红巾为中心的反清同盟。但是第二天孟禄逃走。
凌未风、辛龙子在归途中，经过天山支脉的慕士塔格山，遭遇被楚昭南率众追杀的刘郁芳。原来刘郁芳、武琼瑶、石天成等三人是前往接应凌未风，而这边大军的统帅成亲王格济一面以碉堡战术，逐步推进，一面却叫楚昭南率数百精骑，奇兵突出，以夜间的急行军，在草原边缘衔枚疾进，避过飞红巾的营地，深入喀尔沁草原，想以这队精骑帮助孟禄控制草原各族，令新疆各族分崩离析。楚昭南路遇齐真君，得悉喀尔沁的各族已经奉哈萨克的酋长做领袖，不要孟禄了，遂在慕士塔格山中设下埋伏，却首先遇到接应的刘郁芳等。
冰河上的一番生死决战，刘郁芳坠崖，武琼瑶下崖救援。石天成、辛龙子战死，凌未风因旧病复发被擒。而清廷这仅存下楚昭南和成天挺，包括齐真君在内的其余清廷卫士，以天雄上人为首的天龙派喇嘛也全部被歼，此役堪称反清侠士与清廷卫士最为惨烈的一场战斗。
凌未风被擒囚在布达拉宫，他在狱中也并不空闲，他利用每一个机会，和监守他的武士谈话，感化了看守的卫士马方和周青，助其越狱，可惜功亏一篑。眼见即将处决，韩志邦牺牲自己，利用同活佛的关系以身相替，进而易兰珠等攻进迷宫，救出凌未风，诛杀楚昭南和成天挺。
天山七剑中桂仲明成了武当派北支的开山祖师，按卓一航遗命，张华昭也列入武当门下，学了达摩剑法，算桂仲明的师弟，冒浣莲同桂仲明成婚。凌未风传了晦明禅师的衣钵，飞红巾作新疆各族的盟主，一生都在草原之上驰骋，主持草原的抗清，凌未风也时常到飞红巾军中帮她策划。武琼瑶嫁给李思永，助其继续抗清。天山之友刘郁芳带领天地会和鲁王旧部继续抗清大业，同凌未风相忘于江湖。
此后数年，草原的抗清大业仍在继续，但是终敌不过清军势大，清廷终在回疆确立了其统治，但是草原辽阔，清廷也无法完全消灭各派反清力量，双方的斗争一直持续下去。其余各股反清力量也终因清廷的势大而遭到重大打击，李思永在川西战死沙场，武琼瑶带着一双儿女，回到天山定居。凌未风、易兰珠纵有绝世武功，也无力回天，带着壮志难酬的无奈，凌未风游历藏边，攀登珠峰，最终未能登至峰顶，在其力竭之处刻下“人天绝界”四字。易兰珠继续了天山的衣钵，在张华昭死后，也归隐于天山中。
之前受凌未风感化并助其越狱的卫士周青，凌未风脱险后收其为记名弟子，授以追风剑法、飞芒，并将游龙剑传给他。清廷这边却视之为叛逆，对他的追捕长达数十年，周青只能东躲西藏，但是也结交了不少热血男儿。
中原武林少林、武当等名门正派，为了保住本派基业，不敢公然打出反清旗号，清廷碍于这些门派的影响力，且统治形势已得到稳定，也无意剿杀各大门派，双方得到了一定程度的妥协。部分不甘妥协的英雄豪杰，虽然有心继续反抗斗争，但碍于清廷势大，且多股反清势力都遭到扑杀，无处可依，只好隐忍起来，吞声忍泪！伏身草莽，待隙伺机，如无极派的钟万堂，终南派的武成化等都以各种身份隐藏于民间，一方面等候时机，另一方面则是培育下一代抗清的骨干，将大业传承下去。而越来越多贪图富贵的武林中人则为清廷所用，此消彼长，清廷的统治稳固下来。
康熙中晚期，清廷统治根基早已稳固，在前期的抗清的斗争中，多少武林侠士献出了生命，侠义道力量受到了重大的打击。就在此时，武林中又出现了一位绝世高人──独臂神尼。据武林前辈所传，她本是明朝最后一个皇帝允祯皇帝的幼女，名叫长平公主。闯王进京，崇祯在煤山自缢，临死之前，担心长平公主受到侮辱，用剑斩她，斩断一臂，长平公主倒在血泊中挣扎呼号，祟祯拥剑叹道：“谁教你生在皇家！”长平公主才得以保全一命。后来闯王入宫，优礼明室，见长平公主惨状，叹道：“上何太忍？”叫宫女扶她回宫调养，并请御医给她治疗。长平公主目睹山河沦丧终无力回天，最终隐居邙山，潜心苦修武学，终成一代武学大师，武林中尊称为独臂神尼。独臂神尼武学渊博，以一人之力开创邙山派的武学根基，且晚年更是苦心钻研绝世剑法，手创“玄女剑法”同天山派的天山剑法、武当派的达摩剑法鼎足成三，开创武学史上新篇章。
作为前明公主，独臂神尼虽无力回天，但是怀着国恨家仇，将反清的种子传播下来，先后收下了八名徒弟，分别是了因和尚、周浔、路民瞻、曹仁父、白泰官、李源、甘凤池、吕四娘，称“江南八侠”。早期以了因武功最强，甘凤池声名最盛，后期关门弟子吕四娘得到玄女剑法真传，呈现后来居上之势。八侠多能矢志抗清，为恢复汉家山河而奔波，但是首徒了因和尚却是贪图富贵享乐而背叛师门。
在此期间，浙东名儒吕留良在明亡之后，拒绝清廷微聘，削发为僧，著书宣传攘夷，多名文人学士接受了他的学说，除其儿子吕葆中、吕毅中外，门生严洪逵，以及当时著名文人学者杭州车鼎丰，温州孙克用，青州周敬舆，襄城黄补庵和永兴曾静等都受其影响，而独臂神尼的关门弟子吕四娘即为吕留良之孙女。
康熙二十五年前后，康熙帝在宫中召幸了一名为海棠的宫女，生下一子，后托付朋友在宫中当卫士的周青（即凌未风之记名徒弟）带出宫外妹夫唐万英家中，取名唐晓澜，后周青叛出清宫，在受到清廷追捕期间，将唐晓澜托付给到好友冯广潮门下，拜冯为师，习练追风剑法和飞芒暗器，并将游龙宝剑传给唐晓澜。
康熙晚期，清廷同反清侠士之间的斗争，出现了一定程度的缓和。主要原因是清廷扑灭了各主要的反清势力，统治得以稳固，反清侠士暂无力大举，只好隐忍下来，等待时机。如无极派高手钟万堂则避居河南陈留县，传授资质过人的年羹尧修文习武，为未来的抗清大业培育人才。而康熙帝多少也有点满足于自己取得的功绩，其一生戎马，武功极盛，到了晚年，颇思沽名钓誉，堰武修文，让臣子编写了著名的“康熙字典”，基于此对个别反清侠士的扑杀未及早期般凶残，各省督抚更多采用笼络的手段软化、拉拢武林人士，这也使得如周青般的人能够逃避追杀多年。但这种缓和却随着康熙晚年各皇子之间争位的斗争而被打破。
康熙子女甚多，有十六个皇子七个公主，最得他宠爱的是十四皇子。四皇子人最精明，知道父皇不喜欢自己，阴谋夺位，更是加紧，一面勾结国舅科隆多，一面养育死士。血滴子是西藏一个红教喇嘛所创，这喇嘛为四皇子所用，血滴子也便传给了四皇子手下的武士，同时礼聘了如海南龙木公、神魔双老等高手。为讨康熙欢心，更为扩大势力，允祯手下高手及血滴子对抗清侠士大肆捕杀，如周青等清廷通缉多年则更被列为扑杀对象。周青在前往太行山参加北五省英雄聚会途中，至京师被一路追杀，在河南地界被血滴子所伤，逃至河南汝州冯广潮家中，这时唐晓澜已在冯门下学艺数年。这天适逢冯广潮两个孙女冯瑛、冯琳满月之喜，冯家除冯广潮，其子冯英奇、媳妇邝练霞以及徒弟唐晓澜外外，冯的亲家邝琏、无极派的钟万堂也均在冯家做客。
四皇子属下龙木公、雷海音率血滴子，在内奸冯广潮徒弟王陵的配合下，追杀至冯家。一番激战，周青、冯广潮、冯广潮被杀，钟万堂抱着冯琳逃脱，邝琏负伤而逃，唐晓澜、邝练霞抱着冯瑛、王陵（内奸身份尚未暴露）也得以逃脱，奔至太行山。
这年中秋恰是北五省豪杰每十年聚会之期，地点就在太行山上，唐晓澜等意欲上太行山寻求义侠之士帮助，孰料四皇子允祯知北五省豪杰今年在太行山集会，竟思一网打尽，以取父皇宠爱，而为夺位之谋，于是派出三百名武士，其中有血滴子百余，分出部分追捕周青，另外一大群武士则由神魔双老萨天剌、萨天都率领，直扑太行山，沿途已伤了许多帮会的人，中秋之夕，更在太行山上和北五省数百豪杰大战，杨仲英铁掌神弹，连毙十余武土，却被八臂神魔萨天刺毒抓抓伤，幸为关东四侠所救，这一场大战，北五省豪杰死伤过半。而唐晓澜等由于不知内情，上了太行山，由于奸细王陵的出卖，一行人被双魔所擒。
关东四侠面对神魔双老率血滴子血洗血洗太行山英雄会，重创铁掌神弹杨仲英的凶焰下，凭借着强大的斗志与之进行了殊死的搏杀，先割了血滴子四十双耳朵和射瞎了二十双眼睛，让一众血滴子为之胆寒，大张正义之音，而后一番搏杀，四侠虽最终不敌，但是救出了唐晓澜，退至邙山途中，将出师门的吕四娘凭借着过人的武功和独臂神尼的威名力挫双魔，救下的四侠和唐晓澜。此役过后，吕四娘出师，唐晓澜拜至杨仲英门下学艺。
而允祯的势力也日益庞大，越来越多的高手为其所用，除神魔双老和其心腹侍卫哈布陀外，还有南疆的海云和尚、星宿海天叶散人、形意门董巨川、巨盗甘天龙，同时还诱惑海上巨盗鱼壳大王，要他扶助登基，事成之后，把山东割给鱼壳，让他在海上称王，兼做山东总督，只要来朝，不须纳税，由于禁不住诱惑，鱼壳为其所用。这时声名正盛的江南八侠老五白泰官同鱼壳之女鱼娘相恋，不满鱼壳所为，而同鱼壳反目，同鱼娘也不能相见。允祯进一步扩展力量，招揽了江南八侠之首了因，许以宝国禅师之位。
留书出走的唐晓澜，在青岛追查采花案件中，结识了白泰官和易装的吕四娘，共赴田横岛鱼壳的宴会，会上吕四娘恶斗了因，三人遇险，幸有武林前辈易兰珠解围和鱼娘拼死相救，方得以离开。少林长老本元禅师也至青岛追查采花案件，最终指向王尊一（允祯）。
钟万堂苦心培养的弟子年羹尧叛变投敌，帮助允祯逃脱少林寺的制裁，而后又出卖师傅，致钟万堂为双魔所杀，冯琳落入敌手。易兰珠此时已从双魔手中抢得之前被劫的冯瑛，收在门下，唐晓澜再次随易兰珠上天山学艺，正式成为天山派弟子。
吕留良弟子严洪逵的日记，极意低斥满州，凡当时灾异祸乱，都详加叙述，不稍隐讳。这本日记被他的一个学生盗去，偷偷告发，官差来捕，严洪逵和吕毅中恰巧出门。吕葆中和沈在宽则被捕了。其时吕四娘师兄周浔同朝元寺的主持一念禅师拼死相救，把吕葆中劫了出来，一念禅师已经因伤重死了。吕四娘在师兄路民瞻、甘凤池相助下，终在浙江巡抚李卫和允祯手下董巨川、甘天龙手上救得沈在宽，但沈以成残废。吕四娘在仙霞岭同沈在宽结伴为其治伤，历经五年。
康熙各皇子争位的斗争日渐激烈，尤其以四皇子允祯、八皇子允祀、十皇子允娥、十四皇子允等最力。唐晓澜艺成下山，到京城获知自己的身世，却同关东四侠及师傅杨仲英发生误会，求助于吕四娘。吕四娘、甘凤池力助唐晓澜，在澄清事实过程中，又联合关东四侠击败韩重山、董巨川等，消灭了死灰复燃的铁扇帮，击败允祯手下高手削弱了允祯的新发展的一个外围势力，白泰官和渔娘得以重聚，唐晓澜同杨仲英尽释前嫌。
甘凤池、吕四娘至杭州营救路民瞻过程中，分别在西湖同了因决战一场，又在客店中韩重山、董巨川再战一场，双方旗鼓相当，不分胜负，但救出了落入敌手的名士车鼎丰。吕四娘随后结识了“天山七剑”之一武琼瑶之子李治，李治又初次结交了失去记忆的冯琳。
李治落入敌手，冯琳又意外遇到少时同伴即叛师投敌的年羹尧，这时年羹尧已成为清廷统兵大将，为唤醒冯琳的记忆，年让冯回到儿时住过的地方。了因遇上李治的舅舅武成化，一场大战，武成化略占上风，武成化同时救出了李治。与此同时，吕四娘等救出了落入敌手的路民瞻。并得少林高僧本无大师相助，从韩重山等高手手中逃脱。但本元大师随后却被年羹尧伙同了因等害死。
吕四娘、甘凤池等护送本元大师之徒印宏和尚上少林，少林寺已事先预料到允祯与年羹尧都出自少林，允祯若登大宝，有年羹尧助恶，少林将面临一场大劫到了。主持无住禅师提早做好准备工作，少林寺僧便要渐渐疏散了，我想在福建的莆田和广东的南海再建根基，将少林寺僧渐渐疏散了，想在福建的莆田和广东的南海再建根基。
下了少林寺，甘凤池、吕四娘等前往北京，准备同曾静和关东四侠会面，共商大计。而这时奔走在外的曾静也提出了自己的复国方略，即从两方面入手，一方面是策动清军中的汉人将领造反；另方面是设法令他们自相残杀。为此他说动了唐晓澜假意投入十四皇子允禵军中，意图挑动其同允祯的内斗，唐晓澜通过考验，顺利进入允禵军中，挑起矛盾。
雍正年间
众皇子争位，允祯技高一筹，下毒手杀害了重病的康熙，篡改了“正大光明”的匾额之后遗诏，改“传位十四皇子”为“传位于四皇子”，登上大宝，成为雍正皇帝。
允禵待允祯登位之后，连夜赶回军中，想不到年羹尧已以迅雷不及掩耳的手段，削弱了他的兵权。原来年羹尧一到，便将允禵的二十八个营的带兵军官召集了来，宣布允祯即位，要他们效忠。这些带兵将领虽然都是允禵的心腹，盼望允禵能够登基，可是一听到允祯已坐上宝座，过半数的军官都变了心，连允禵最可靠的飞龙军中的十二个营的统兵官也动摇了！允禵回到军中，连夜召集心腹将领会商，十二个飞龙军的统兵宫中有七个不赞成与年羹尧作对，允禵上表奏请西征，雍正传下圣旨，叫他过了新年，便立刻统兵西征，并由此而想到处置了因等人的办法，把了因、萨天都、萨天刺、董巨川、甘天龙等五人，调到年羹尧军中，叫他们帮助年羹尧西征，暗中却传见年羹尧，说道：“这五人中除了董巨川较为懂得大体外，其他四人都是野性难驯，到西征之后，若这四人未死，你就替朕除了他们吧。”在另一方面，允祯也吩咐这五个人，叫他们监视年羹尧。
年羹尧收买了允禵“军中二宝”之一的车辟邪，对另外一人方今明则意图加害，与此同时，年羹尧奉了圣旨，取代允堤就了抚远大将军之职，允禵的近卫军全数被歼，最亲信的七名军官也被杀了，允禵和博克图则在席上披擒，生死如何，不得而知。方今明、唐晓澜幸为关东四侠等相救脱险。这时在天山学艺的冯瑛也已艺成出师，由于同冯琳长得酷似，多次被人误会。
年羹尧向了因下手，被其识破逃脱，了因劫持江南八侠之六李源上京，途经邙山，被同门师弟围攻，惨死在吕四娘剑下，同时丧命的还有雍正属下高手甘天龙。
与此同时，雍正派人火烧少林寺。好在少林寺主持无住禅师料知浩劫将临，早两年己命少林寺的僧侣携带法物经卷，暗中疏散，一支走福建莆田，一支走广东南海，在少林寺被火焚的前夕，寺中僧众已十九疏散，无住禅师以身殉寺。
雍正又派兵将吕留良的族人全捉了去，只逃出了一个吕元。而且除了把吕留良的著作毁版焚书之外，又将吕留良吕葆中的坟墓挖了，掘出尸体，戳尸枭示。面对国恨家仇，吕四娘矢志报仇。
逃出年家独自闯荡江湖的冯琳先是杀了河南抚衙中的第一高手王敖，但身中暗器，幸在少林寺废墟中为李治所救，但随后又陷入雍正的包围中，为救李治，冯琳只好回到年家。依靠冯琳的机智，两人最终脱险，但是冯瑛又落入雍正手中。
为寻冯家姐妹，唐晓澜进入宫中，凭借着康熙遗物和掌握的宫廷秘密，救出冯瑛，但是服下了一年后发作的“毒酒”。唐晓澜携冯瑛至杨家，不久却碰上为王敖报仇而将冯瑛误认冯琳的唐金峰父女，一场激战，杨仲英中毒针而成残废。
雍正解决了少林寺后，又在山东抚衙中暗算鱼壳，同时派出水师直捣其鱼壳水寨。鱼壳水寨被攻陷，本人及属下高手卫扬威、孟武功幸为甘凤池、唐晓澜、冯瑛所救，在向海上逃亡中误进毒龙尊者居处蛇岛，数场激战，又得后来的吕四娘得增援，收服了毒龙尊者。此役期间间，唐晓澜、冯瑛杀了回到猫鹰岛的神魔双老，报了家仇。
离开蛇岛，众人改装易容，偷入京师，到了京师，这时年羹尧在山东班师之后，已远征青海，京中各皇子，或被杀害，或被贬黜，或被剪赊羽翼，均已无能为力。雍正广招武士，大修宫殿，挑选秀女，点缀得一片“升平”气象。密宗高手额因和布为雍正所延揽，接替了因之位。冯瑛进宫为唐晓澜求取解药，最终失败，幸为侯三变所救。在李治的医治下，唐晓澜最终“病愈”。邝琏、邝练霞、冯瑛、冯琳一家团聚，手刃仇人龙木公，冯琳的失忆症也得以康复。
曾静遣他的学生张熙去游说年羹尧的副手岳钟琪，附会穿凿，力证岳钟琪是岳飞的后代。“曾静并写密函叫张熙带去，说岳氏和金人乃是世仇，岳家子弟不应做胡虏的大将，居然劝岳钟琪和他密谋举事。岳钟淇佯为答应，将曾静诱来，逼他供出同党之人！”曾静被俘变节，供出吕留良门下弟子多名，岳钟琪随后飞摺上奏，因此掀起轩然大波，朝廷到处搜捕吕留良遗党。在曾静未解到京之前，吕留良门下弟子严洪逵被处斩，沈在宽幸得其弟沈在英相替，逃过一劫，但沈在英随严洪逵一同被斩。与吕留良案有关的首脑诸人，幸亏甘凤池派人通知得快，大半都能逃脱，只是青州周敬舆、襄城黄补庵，以及许多刊刻吕氏书籍与及收藏吕氏书籍的人，都被株连坐罪，或被处死，或被充军，卷起了轩然大波，过了半年，方才渐告平息。
吕四娘接过凶讯后，到京城打探消息，被红教掌教昆甸上人率清廷高手围捕，幸得群侠接应及毒龙尊者出手相助，大败清廷高手，击毙昆甸上人。
吕四娘随后同甘凤池夜探年羹尧军营，获知曾静变节之事。年羹尧释放曾静、张熙，并将儿子托付于曾静，同时处决了雍正属下高手董巨川。年西征凯旋，功高震主，雍正暗起杀机。
吕四娘矢志刺杀雍正，留在邙山边为师傅守墓，边将剑法练得出神入化。李治与冯琳相偕入川，联络父亲李思永的旧部；甘凤池赶江南一带拜访一些帮会的首领，令他们不与官府同流合污；鱼壳父女与白泰官也重新出海，访寻还剩下来的各岛海盗，唐晓澜与冯瑛相偕前往天山。
两年后，年羹尧终为雍正所杀，隆科多被判永远监禁，妻子家产，则免于抄没。冯琳和李治这两年来在四川冒了许多艰险，联络了一些人，后来听得年羹尧被撤职查办，便把四川的基业交给车鼎丰的儿子车哲生主理，回到中原，途中同关东四侠相遇；唐晓澜、冯瑛艺成再度下山，途中协同唐金峰救下了年羹尧之子，年羹尧之子为唐家所收养；数日后，群侠再度聚首邙山。过了半月，吕四娘和甘凤池联络上了，仗着甘凤池的人缘极广，各路英雄，都陆续混入了北京，准备刺杀雍正。
雍正杀了年羹尧后，也预防会有刺客行刺，不但在宫中遍布卫士，而且连宫廷的一些旧例，如节日可以演戏作乐之类，也全都禁了，自己更是每晚更换宿处，提心吊胆，处处提防，群侠在京半年，未得机会下手。
过了新年，元宵佳节，雍正决定开禁，大大作乐一番。除了原有的内庭供奉，教坊歌舞，可以招来演出之外，还准许近亲贝勒，各各供献节目。甘凤池等化装混入雍正之十六允瑛挑选的杂技班中，于元宵之夜趁机行刺，但是功败垂成。此役先后折了关东四侠之老四陈元霸，侯三变，余人得以脱险，离开京城。
三个月后，吕四娘、冯瑛、冯琳化装成秀女，混入宫中。又过三个月，雍正见半年无事，又见冯瑛的画像，遂到翠华宫中。吕四娘、冯瑛、冯琳三女侠联手，终于手刃雍正，上演“内苑屠龙”的一幕，并带走雍正的头颅，祭过她的祖父、父亲。此役，清廷高手额因和布、哈布陀同时被杀，之后，其中关东三侠到关外游侠，鱼壳父女与白泰官扬帆出海，路民瞻偕李明珠归隐田园，这后关东三侠到关外游侠，鱼壳父女与白泰官扬帆出海，路民瞻偕李明珠归隐田园，吕四娘和沈在宽结婚后隐居邙山，习武修文，唐晓澜和冯瑛历经波折，终成眷属，同冯琳李治回转天山。
乾隆年间
雍正被杀后，其四子弘历继位，年号乾隆。碍于皇家体面，清廷不敢公开雍正的死因，对外称暴病身亡，为此清廷也不便公开通缉吕四娘等人。此后数年，清廷与反清侠士之间的斗争又出现了一定程度的缓和时期。在清廷方面，乾隆初登大宝，内政外交千头万绪，稳固权力为其首要事项，故未能腾出更精力追缉反清侠士。于反清阵营中，苦心筹划完成的惊天一刺，此举虽极大振奋了人心，但也付出了重大代价，需要进行休整。同时反清侠士也意识到，推翻清廷将是一个长期的过程，需要几代人的不断努力，在时机未成熟之前，盲目举事只会造成不必要的伤亡。刺杀行动虽然大快人心，但是对反清事业意义不大，需要更进一步积蓄力量，等候时机。
由于清廷和反清之间得到一定程度的缓和。此后数年，少林派利用这个时机得以重建，此前少林寺虽然被烧，但由于无住禅师事先做好准备工作，所以伤亡其实不大，更由于少林一脉源远流长，因此不出数年，少林重现武林第一大派雄风。武当一派自桂仲明夫妇归天后，其长子石广生、次子冒川生武功虽高，但是均非领袖之才，三子桂华生则由于败在唐晓澜、冯瑛联手之下，远走异域，立志再创一派剑法，同天山剑法争胜，因此武当派再度呈现盛极而衰之象。邙山派的江南七侠除吕四娘外都广收弟子，邙山一派在武林中崛起，几同少林、武当鼎足成三。天山派唐晓澜在易兰珠逝世后继任掌门，通过整合晦明禅师、白发魔女两个派系，形成统一规模的天山派，其声势地位逐渐超过了中原武林三大派。
几年后，桂华生游历至西藏，无意遇见了年羹尧的部将葛腾龙带着年羹尧之子来到西藏，原来葛腾龙想利用年羹尧的儿子作为号召，以遂个人野心：同时见唐灵（年羹尧之子）天赋聪明，是个可以扶得起来以图王霸之业的人，故此不惜费尽心机，冲难犯险，将这孩子诱出唐家。但至西藏却中毒而昏迷，桂华生救治他们后，，事葛腾龙约定，让唐灵回家，待其长大后自行抉择未来的路。桂华生此番抵达异邦，历一番奇遇，成为尼泊尔驸马。此后又同其妻华玉公主出走，在念青唐古拉山的天湖之上达起冰宫，创立了冰川剑法，为武学中发一异彩。可惜桂华生夫妇均英年早逝，其独生女儿桂冰娥成为冰宫的新主人，号冰川天女。
数年后中原另一名门正派丐帮由于人才凋零，青黄不接，时任丐帮帮主冷白涛只好同甘凤池商量，让其门下一名弟子投入丐帮，并作下任帮主人选，甘凤池征询弟子的意愿，大弟子吕青素性闲散，三弟子年纪还小，结果便由二弟子周骥投入丐帮，后来成为丐帮的第十七代帮主，这也使得丐帮和邙山派长期结成紧密的联盟，使得邙山派力量规模更为壮大。孰料又过数年，周骥与两个丐帮弟子突然在山东道上被人暗杀，死时全身青紫，体冷如冰，丐帮明查暗访，竟不知是谁所害，便奉铁拐仙吕青做帮主，吕青为了要报师弟之仇，只好勉为其难。
又过数年，年羹尧之子长大成人，为报父仇，也为成一番事业，他将目光投向西藏，化名龙灵矫，号龙三先生，投入清军统帅驻藏大臣福康安福康安帐下，受到重用。
数年后，清廷乾隆的统治稳固，反清力量无机可乘，但也没有作无谓牺牲，而是利用这一时期休养生息，增强力量。吕四娘、冒川生俨然成为武学大师。冒川生每十年一次的开山结缘主讲武功妙理，并因人而施，指点诀窍，以培育武学后备人才。而吕四娘由于同清廷之间的关系使得其少于公开露面，以隐居为主。这时大侠甘凤池和余下江南诸侠先后逝世，邙山派开始进入后七侠四代。代表人物有甘凤池之徒吕青、翼仲牟，曹仁父之女儿曹锦儿，白泰官之子白英杰等，吕四娘也开始收下两湖大侠谷正朋养女谷之华为徒；唐晓澜、冯瑛生下儿子唐经天；李治、冯琳和女儿李沁梅；避居东海蛇岛的一代奇人毒龙尊者也收下弟子金世遗。避祸西藏的青城派高手萧青峰收下清廷西藏萨迦宗的宣慰使陈定基之子陈天宇为徒，武林逐步进入了一个更新换代的时期。
这时清廷的势力已基本控制了西藏，为解决转世活佛的真假引发的纷争，更好地控制西藏，乾隆决定颁发一个金本巴瓶（本巴是藏语“瓶子”的意思）。若有纠纷，就叫吹忠将各个被认为是转世活佛的名字，各写一签，放在瓶内，对众拈定。听说这个金本巴瓶就快要由北京颁发，到时达赖班禅以及各僧俗官员，都要举行极隆重的迎接仪式，然后将它供在拉萨市中心的大昭寺楼上，从此永传后世，作为西藏最最重要的圣物。
金本巴瓶关系重大，引起了各派势力的关注，清廷方面要保证金本巴瓶有护送，而部分反清力量生怕西藏接受了金本巴瓶之后，政教制度都受朝廷的规定，因此誓死从中破坏。而早有侵入西藏野心的尼泊尔皇帝以及印度土王也要通过夺得金本巴瓶而控制西藏。就藏民本身而言由于最崇拜活佛，视金瓶为圣物，也希望平安送到，就潜服在福康安帐下的龙灵矫而言，也希望有这场争夺中得到什么。因此围绕着金瓶的护送，各方尽出高手，展开了争夺与反争夺，丐帮帮主铁拐仙不幸丧命于冰宫中，最终天山派唐晓澜及儿子唐经天面对复杂的局势，作出更为清醒的权衡，认为两害相权取其轻，让清廷保有西藏，总胜于让与异邦。这金瓶万万不能劫夺！唐经天联合冰川天女共同出手，并说服了中原群雄，协助福康安和龙灵矫完成了金瓶的护送，挫败了异邦势力的野心，这也是反清力量同清廷一次少有的合作。
正当龙灵矫顺利完成金瓶护送，准备大展身子之际，其身份已被清廷所侦知，派出高手赤神子等予以缉拿，龙灵矫怕多年心血白费，不敢逃跑。经多方斡旋，龙灵矫暂由福康安看管。福康安的主意是要先问明皇上，再行发落，这样一来一回，最少也得半年，龙灵矫的案子就被搁置起来.
印度喀林邦土王为夺取西藏，派出奸细俄马登，假手前藩王之女芝娜，杀了当地土司，欲借此挑动西藏的内乱，但最终阴谋被唐经天、冰川天女、金世遗所破。
为争夺西藏控制权，尼泊尔国王派出第一国师泰吉提，从福康安手中救出龙灵矫，妄图借龙之力图谋西藏，但龙灵矫不愿为其所用，逃出尼泊尔军营，为唐经天等所救，此后龙灵矫消除了争霸之念头，携妻隐居。在中尼边界的喜马拉雅山山谷中，唐经天、冰川天女凭武技折服了尼泊尔国王，福康安又率军展示了军威，共同使得野心勃勃的尼泊尔王平息了入侵之念，及时消除了一场兵灾。
保卫西藏之役，是侠士同清廷一次少有的合作，一定程度上缓和了双方自清初以来那种尖锐的敌对，反清阵营的天山派代表唐经天，同清廷官宦之家的公子陈天宇甚至成了很好的朋友，如坚决反清的麦永明同武氏兄弟也能辨别清廷同印度、尼泊尔等势力存在本质上的区别，这多少也说明了清廷得到了反清阵营有限的认同。在此期间，唐经天和冰川天女成就金玉良缘，而金世遗则拒绝了李沁梅的爱意，独自飘泊江湖。
此后数年，清廷同反清阵营没有出现大的冲突，各派的力量得到进一步发展，一代宗师宝剑屠龙的吕四娘逝世，邙山派由曹锦儿接任掌门，而丐帮则由吕青的师弟翼仲牟接任帮主。浪迹江湖的金世遗结识了邙山派吕四娘的徒弟谷之华，双方一见如故，引为知己，但不久谷之华则因身世原因为曹锦儿逐出门墙。期间一次小规模的冲突是邙山派叛徒了因之徒弟灭法和尚同其两名弟子御林军官秦岱、耿纯一道，意欲夺取邙山掌门之位，为谷之华和金世遗所败。此举虽然是邙山派内部之争，多少有清廷御林军的挑唆因素，这时清廷由寇方皋任大内总管，司空化任御林军统领。但是反清侠士在缓和同清廷矛盾的同时，却又面对武林内部邪派力量的挑战。大魔头孟神通艺成之后意图称霸武林，向各大门派发起全面挑战，一时间打得各大门派措手不及，伤亡重大，迫得正派不得不联合起来应付这场浩劫，这时金世遗同孟神通的仇人之女厉胜男也艺成归来，向孟神通开展复仇，使得孟神通处于双线作战的不利局面之中。
清廷趁孟神通大闹武林之际，也筹划将正邪两派不肯归顺清廷的一网打尽。除了寇方皋和司空化的人马外，暗中延揽了武林中另一魔头西门牧野，再由西门牧野出面招揽了多名一流高手，其中包括了西藏黄教的高手无非大师、四笔点八脉闻名的点穴名家连氏兄弟、冀北三魔等，组建成为一支秘密队伍，于正邪两派高手邙山决战之际，先放以奇毒，再大施屠戮，让得正邪两派都损失惨重，并且擒得包括邙山派掌门曹锦儿在内的多名正派高手。但不久之后，以唐晓澜为首的正派侠士立即开展营救行动，唐晓澜闯入宫中，劫持十五皇子颙琰，迫使清廷放人。期间金世遗也暗中帮助下，由于西门牧野同厉胜男、孟神通都是仇人，这支队伍在京城先后被厉胜男、金世遗、孟神通多番击杀，伤亡惨重，西门牧野也死在厉胜男手中。
曹锦儿在遭受连番打击下病死，临死将掌门之位传给谷之华。清廷方面寇方皋方面同孟神通达成合作的协议，共同对付反清侠士和金世遗、厉胜男。暗中却趁孟神通在少林寺外嵩山千幢坪比武之机，事先埋下炸药，意图将正邪两派一网打尽，此计幸为金世遗所破，寇方皋也死在孟神通掌下，孟神通也为厉胜男所杀。三年后厉胜男在天山比武中多次使用天魔解体大法战胜唐晓澜之后，以谷之华身中之奇毒迫使金世遗同其成亲，并在成亲当晚身亡。金世遗在解了谷之华身上之毒后，独自漂流海外。邙山派在多番的打击下，好在谷之华在正派侠士中已树立了良好的声名，各派宗师都对其敬重有加，在谷之华的接掌下，顺利的渡过危机。
此后十多年，清廷统治稳固，反清侠士未能找到机会，而清廷也未能赶尽杀绝，双方未有大的冲突，清朝渐渐步入乾隆后期，和坤当权。而金世遗已成为天下第一高手，金世遗的弟子江海天、谷之华的养女谷中莲、唐经天之子唐嘉源等也长大成人。虽然已是多年未有大的冲突，但是面对灭中原反清的代表邙山派，清廷还是时刻想扑灭之。为此清廷又延揽了东海无名岛主文廷壁、昆布兰国金轮圣母童姥姥，联同以崆峒派高手佟元奇为首的二十四名大内高手，打着为天魔教复仇的名义进攻邙山。邙山派在掌门谷之华率领下，联同青城派掌门辛隐农，南北丐帮帮主仲长统、翼仲牟以及江海天等奋勇抵抗，关键时刻，金世遗出现，废了文廷壁的武功，击毙童姥姥，并一举挖出了七名大内一流高手的眼珠，此役极大地打击了清廷卫士的势力，令得清廷侍卫很长时间不敢再走江湖，这一役可说是反清一方一次对敌的重大杀伤，其意义同凌末风纵横塞外、吕四娘深宫屠龙相提并论，成为反清侠士扬眉吐气的事迹，多次为后人所提起。
不久之后金世遗同谷之华、江海天同谷中莲同日成婚。谷之华将掌门之位交予谷中莲后，同金世遗一道隐居海外火山岛。江海天逐渐成为中原武林领袖和公认的天下第一高手，称得上群雄归心。
此后十几年反清侠士同清廷之间又处于一个相对平静的时期，双方基本没有大的冲突发生。期间天山派掌门唐晓澜逝世，唐经天接任掌门。中原名门正派中，一些武林长老名宿如少林派的痛禅上人，峨眉派的金光大师纷纷故去。执掌少林派的大悲禅师、金光大师的嫡传弟子法华上人均是有道高僧，勤修佛法，与世无争。武当派的掌门雷震子在几次武林劫难受挫后痛定思痛，钻研武学，以上门派都是家大业大，不好过于明目公开树起反清旗帜。其他一些小的门派则是限于武功、声望，未能担负起领导之职。发展较好的门派一是丐帮，南北合并之后，声势大盛，且仲长统的武功和才干均在翼仲牟之上，使得丐帮声威日振；另一门派则是青城派，同样也是由于辛隐农的武功和见识、才干均是一时之选，远超过前掌门韩隐樵，因而两派的声势均呈现出极强的上升势头，清廷方面同样由于清廷侍卫在氓山受到重创，二十多名一流高手一次性毁灭，毕竟当世的高手还是比较难觅，更何况对某些对高官厚实禄心动的武林中人也要想想后果，以致很长时间不敢行走江湖，而是专心护卫京城，很长的时间中，双方基本保持相安无事，但各自积蓄力量，候待时机成熟，给予对方以沉重打击。虽然中原反清的力量无多在的作为，回疆草原上的抗清斗争却一直在断断续续的进行中，谷中莲的兄长叶冲霄同妻子欧阳婉在回疆多年协同抗清。
嘉庆至道光年间之上篇
一晃眼十多年过去了，清朝也从乾隆时期进入嘉庆时期，统治力盛极而衰。在此期间，江海天夫妇凭借着卓绝的武功，以及金世遗衣钵传人的身份，经过十多年的努力，终于成为新一代的侠士领袖，声望直逼乃师。谷中莲也逐步地行使氓山掌门大权，尽管谷中莲长期随夫居于山东东平县，氓山的日常事务基本还是以白英杰为首的几名三代大弟子打理，但是重大事项谷中莲已经行使了掌门人的决策，氓山派在此期间也得到慢慢发展。
大门派方面，钟展、大悲禅师、法华上人等均已步入当世一流高手的境界，其他掌门如雷震子等也武功大进，青城派和丐帮的声势日盛，几与少林、武当并立，各大门派的实力都在不同程度得到增强，同时涌现出一批新一代的骨干人才，如青城派的萧志远、丐帮的元一冲，乃至天山派的钟灵等等。
清朝也从乾隆时期进入嘉庆时期，统治力盛极而衰。但这时清廷方面也网罗了众多的高手。主要分派在大内总管朴鼎查和御林军统领手下。称得上一流高手的有大内总管系的风从龙，御林军副统领贺兰明，而另一名御林军副统领李大典，以及卫士彭洪、黑木大师、彭洪等也算得上二流好手。清廷又网罗武林败类祈连三兽，再通过祈连三兽牵线聘得其主人杨钲，补充了绝顶高手方面的空缺。
清朝的统治在当时已是由盛而衰，各个层面的反清势力也都得到发展。一方面势力是嘉庆年间在京畿、直隶、山东、河南等地兴起的天理教，教主张廷举，副教主林清，骨干力量如李文成、张仕龙等，势力及影响不断扩大，遍及各地。另方面势力则来自尉迟炯为首的大盗，专门抢劫大户，随着这两方面势力的不断扩张，各地类似的起义也不断发生，危及了清廷的统治。当然与此同时，地方地主势力也得到扩张，如归古愚拥有自己的防盗武装，称霸一方。上述情况理所当然地引起了清廷方面的不安，开始筹划对各派反清势力开展大的镇压。
天理教的日益成熟壮大，影响范围不断扩张，已成为危及清廷统治的心腹之患，镇压天理教成为清廷首先要完成之事，清廷通过收买天理教的叛徒，莸悉天理教设在保定的总坛，之后发动攻击，一举攻破天理教的总坛，杀害了天理教教主张廷举，此举重创了天理教。事后清廷对天理教副教主林清展开大规模的搜捕，对天理教的分坛进行扑杀，为保护林清，天理教的多名骨干人物付出生命，如秘密使者李文成假扮林清，引开追捕，最终惨死。李文成的遗孤李光夏、林清之子林道轩等均曾落入敌手，幸得正派侠士倾力营救，江海天仗义出手，这才多次挫败他清廷的追杀，林清得以脱险。期间清廷川陕总督叶少奇之子叶廷宗冒充江海天内侄叶凌风（下称叶凌风），投入江海天门下。
这时冷天禄在小金川高举义旗开启了正面同清廷疆场搏杀的时代，此举一是反清势力云起，清廷对川陕云贵等地鞭长莫及的有利局面，力图打开一个局面，二是牵制了清廷的势力，减轻反清各派所受到的压力，包括对天理教的捕杀。而坚毅沉稳的萧志远加入到冷天禄的抗清队伍中，无疑使得冷天禄如虎添翼，一方面萧志远文武全才，有效提高了起义队伍的文化素质，另一方面也使得青城派成为小金川义军的后盾，在掌门辛隐农的支持下，更多的青城派弟子加入到义军队伍，而且辛隐农更是利用其在正派侠士的地位，发动更多的门派输送人才，此举使得反清阵营一、三方面势力紧密地联结在一起，很快地在小金川打出了一个局面。
而这时曾是西域小国西库车国的王子竺尚父，也秘密集结力量，图谋复国。但是竺尚父的连襟杨钲却已被清廷所收买，阴谋挑动竺尚父同江海天的争斗，以达到一网打尽之目的。
面对反清斗争风起云涌，清廷也大镇压力度。采取措施主要有：一是加大对天理教的镇压和搜捕；二是由川陕总督叶屠户率军围攻小金川；三是派出奸细打入各大门派，及时掌握各大门派的内部动态以及同义军的交往；四是利用各种手段在正派中收买叛徒，冒亲投入江海天门下的叶凌风即被胁迫而成为叛徒；五是在江湖中广设据点，刺探情报实施多项阴谋；六是阴谋挑起以江海天为首的反清侠士同竺尚父的争斗，以坐收渔利；七是抓捕其它威胁破坏清廷统治秩序的江湖人物。以下各项活动在一定期间取得了收效，如天理教被迫转入地下，小金川陷入包围，青城派中出现了蒙永平之类的奸细，在江海天居住的东平县中出现了清廷据点”太白居“，竺尚父同正派侠士在邙山中因误会而大打出手，著名的关东马贼尉迟炯在叶凌风出卖之下被抓，更为可怕的是叛徒叶凌风掌握了援川义军的领导权，足以将整支队伍葬送在敌人的屠刀之下。
对此反清力量沉着应战，天理教副教主林清最终脱险，林清之子林道轩、李文成之子李光夏被江海天收为徒弟，小金川方面继续坚持抗争，同时积极寻求援助；太白居被真正的叶凌风（下称叶慕华）所烧；江海天同竺尚父冰释前嫌，携手抗清；叶凌风也逐渐暴露出疑点而为江海天所察觉，开展了调查。这时林清在连遭清廷追捕的险境中，兵行险着，潜入京城，策划进攻皇宫的行动，目的在于俘虏满清皇帝，制造一个天下震动的局面，既让敌人胆寒，又响应各地义军，而这时，宇文雄、祈圣因、上官泰父女等高手以及天理教的部分好手纷纷集中到京城，还有正在途中的江海天，反清阵营紧张准备着劫天牢、攻皇宫两项惊天动地之举。
劫天牢、攻皇宫，反清和清廷各自一胜一败。就反清阵营一方，攻皇宫，无论成败，都是一次震天动地的行动，特别是天理教在经历了清廷大搜捕，几陷绝境中绝地反攻，既震动了清廷最高统治者，也极大地鼓舞了其他反清势力。劫天牢，成功救出尉迟炯，从而使到以尉迟炯为首的绿林势力不被瓦解，更进一步巩固了双方之间的同盟关系，成为义军和天理教以外一股颇有力量的独立队伍，在日后的反清斗争中发挥了重要作用，如数年后大内总管萨福鼎的寿诞上，尉迟炯组织下属洗劫了寿礼，为义军筹得了一笔可观的军费。同时，通过这两次行动，彻底地查清了叶凌风的真实身份，阻止了进一步的破坏。最后这两次行动也极大的杀伤了清廷方面的高手，继金世遗氓山重创大内高手后，清廷高手遭受的又一次大损伤，此役江海天的风采不让金世遗当年。当然此役也付出了重大代价，反清阵营重要领袖林清重伤身亡，由张仕龙接任总舵主。江海天惊闻真相，一病不起，攻打皇宫方面的失利也折损了不少好手，这些损失都是极为严重。清廷方面则是安排在反清阵营中最大内应叶凌风身份的暴露，致使清廷设下的一系列陷阱行将破产。
江海天派出二弟子宇文雄，赴川揭破叶凌风的身份，在叶慕华的相助下，擒住清廷高手风从龙，叶凌风最终身份暴露，叶慕华成为援川义军主帅。叶凌风在身份暴露后，率军进攻援川义军失败，又潜入小金川，暗杀了冷天禄。之后，叶慕华利用了宇文雄和江晓芙发现的秘道，亲率一队精兵直抵叶屠户部心脏地带，造成叶屠户中军的混乱，加上两部同时发动进攻，一举击败叶少奇。小金川一战的胜利反清阵营尽管付出了冷天禄遭暗杀的代价，但也一举解了叶屠户对小金川的长期围困，令得发展壮大的义军得到了暂时的喘息之机，而赴川的援军也达到进川的目的，虽然有一定的伤亡，但是其中骨干力量基本保存了下来，剩下的任务就是肃清残余的敌人。而这时逃亡的叶凌风仍然不知道主战场的局势，准备到西川借来援兵投入战场，一场针对叶家父子的追击行动就此展开。
就在叶凌风准备借兵西川的时候，准备已久的竺尚父乘小金川之战激烈进行之际，一举率众攻占了西川城，此举顺利进行的原因在于反清和清廷的两大阵营都是盯在小金川之战上，源源不断的力量都投在小金川这片土地上，造成了西川城方面的空虚，而竺尚父则是蓄势以久，趁清廷方面无暇顾及的有利时机突袭西川一战成功，之后竺尚父的部队又顺利击败了清廷第五方面势力归古愚组织的自有武装，断送了叶凌风的希望。最终以萧志远为首的义军，在叶慕华、宇文雄等的配合下，顺利擒杀叶家父子。
这个时期反清方面大获全胜，重创了清廷阵营，胜果一是打破了清廷方面对小金川的围困，使小金川方面得以继续发展壮大，萧志远和冷铁樵成为小金川新一代领袖；二是攻占了西川城，二方面势力形成犄角之势；三是击破了叶屠户的军队，擒杀叶家父子，取得正面战场的辉煌大捷，极大提升了反清各派的士气；四是击破归古愚的地方武装；五是歼灭清廷阵营一大批高手；六是以叶慕华、宇文雄为首的新一代经受了很好的考验，获得了宝贵经验，为未来抗清打下了基础，此役可谓战果辉煌。当然这个胜利也是暂时的，对清廷阵营的统治尚未能予以撼动，围绕着小金川和西川城，清廷也积极筹划增兵添将予以剿杀，反清和清廷两大阵营的你死我活的斗争更为惨烈。
小金川之战结束三年之后，竺尚父占了西昌，数年间四方豪杰，投奔他的很多。清廷趁此机会派出高手帅孟雄，借切磋武功为名暗算竺尚父，打伤上官泰，之后，清兵便大举来攻。竺尚父卧病在床，军心大受影响。结果是西昌又给清兵夺回去了，义军伤亡不少，如今已退入了大凉山中，待机而起。
这时期萨福鼎任大内总管，招揽高手对付各派反清势力。东海无名岛文廷壁之侄文道庄重回中土，同前大内侍卫封子超联手，趁江海天女儿江晓芙出阁的大喜日子，乔装宾客进入婚宴现场，准备以出其不意手段擒住江海天的的女儿女婿，作为人质解上京师，以便清廷招降江海天。即使江海天不受招降，女儿女婿落在官府手中，也总得有几分顾忌，不敢与朝廷作对了。此举为从火山岛归来的金世遗之子金逐流所知悉，在婚礼大典上，金逐流出手阻止，并击败了文道庄。这时竺尚父部上官泰向江海天求救，急调叶慕华、林道轩、李光夏等前往大凉山稳住局面。
萨福鼎借寿礼招揽江湖各大帮派，部分帮派贪图富贵，纷纷上京为萨福鼎祝寿，其中尤以近年崛起的六合帮为甚。与此同时，正道侠士也以截劫寿礼等方式破坏萨福鼎的寿礼。金逐流在上京途中大显身手，多次劫夺六合帮寿礼，最为珍贵的玄铁也落入金逐流手中，并结识了六合帮主史白都之妹史红英，在京城又结识了厉胜男的侄孙厉南星。
萨福鼎寿礼上，以尉迟炯为首的侠士突然袭击，劫夺了大批寿礼，并同以史白都为首的投靠清廷的帮会以及清廷高手发生一场大战，最终成功脱险，玄铁也铸成了玄铁重剑，在此后一系列战斗中大展神威。
史白都以史红英婚姻为诱饵，设计加害金逐流和厉南星，终被识破。金逐流脱险，厉南星受伤为红缨会总舵主公孙宏及其女公孙燕所救。史白都强迫史红英嫁给帅孟雄，竺尚父部也准备趁帅孟雄婚礼之际再度兵进西昌。为配合义军攻城，史红英孤身入虎穴，而金逐流、厉南星等也秘密潜入西昌城。
帅孟雄婚宴上，史红英暗算得手，一场大战之后，竺尚父、叶慕华率军攻入西昌，帅孟雄、史白都及一应投靠清廷的高手被击毙，史红英则取代史白都成为六合帮帮主，此后六合帮同义军结成联盟。为保存实力，避免同清廷硬拼，义军在胜利之后退出西昌城，回到大凉山区。
萨福鼎又延揽了从海外归来以宗神龙为首的“扶桑七子”，向邙山派发动攻击。决战中，邙山派多名高手受伤，形势岌岌可危，幸好此时金世遗、谷之华、叶冲霄等重返中土，打退了扶桑七子。与此同时，孟神通门人阳浩假借厉南星名义成立天魔教，阴谋暗算正派侠士，为江海天、金逐流所破，邪派高手阳浩、文道庄、欧阳坚先后被废武功。，天魔教余下教众和义军盟友红缨会合并，给抗清的义军又添了一股力量。
扶桑七子在铩羽邙山之后，又赴保定，挑了天理教的总舵，幸亏有总舵主张仕龙拚命抵挡，损失才不至于太大。内三堂的香主和留守的弟子大部份逃了出来，听说伤亡的不过十之一二，张仕龙受伤后身死，由林道轩接任总舵主。
萨福鼎派出使者，想利用青海五个盟旗的王公来掣肘大凉山竺尚父部，竺尚父修书，由尉迟炯、金逐流为使者，前往见青海五个盟旗为首的伊克昭盟的土王，晓以利害，并在白教大喇嘛宗达完真的帮助下，最终揭穿了清廷使者的阴谋，而这时萨福鼎因为和一位亲王勾结，把持权柄，贪污舞弊，给他们的政敌参劾，这政敌是亲王加上两位手握重兵的将军，势力比他们更大，皇帝不能不准他们奏，把萨福鼎免职下狱，五个盟旗最终驱逐清廷使者，答应两不偏帮。金逐流同时联合扶桑派的牟宗涛、林无双，分化扶桑七子，击败宗神龙。不久金逐流同史红英、厉南星同公孙燕均成就美好姻缘。
数年后，经过数年的苦心经营，小金川义军已是扎稳了根基，成为抗清人士心中的希望。首领萧志远、冷铁樵领导有方，声势更胜从前，又出现两位少年英杰，孟元超和宋腾霄；竺尚父部的义军继续扎根于大凉山中；天理教由林道轩任教主，在清廷的中心腹地继续秘密的反清事业；金逐流声名日盛，渐与其师兄江海天并驾齐驱，史红英也领导六合帮走上正轨；厉南星接任红缨会总舵主之位，与各路反清力量也时刻保持着联络协作；牟宗涛正筹建着扶桑派；期间江湖又出现一名行侠仗义的豪侠缪长风；江南大侠陈天宇之次子陈光世也开始行走江湖。
嘉庆至道光年间中篇
清廷方面，萨福鼎入狱后，经过活动，无罪释放，复职大内总管，但是在清帝面前的宠信度以及自身的权力都有明显的削弱。而时任御林军统领的北宫望则表现出相当的强势，此人武功高强且阴险毒辣，在其未任御林军统领时，曾带人杀害了抗清志士武定周夫妇，在其升官道路上布满了反清侠士的鲜血，上任御林军统领后，一面招揽高手，包括唐门三老之一的唐天纵、点穴高手连甘沛、玄风道长、炎炎大师等一流高手都效力其帐下。同时，北宫望还加紧笼络急于在中原打开局面的牟宗涛，诱使其为已用；另一方面，北宫望采用各种手段捕杀反清侠士，更挑动正道中人内斗，以从中取利。面对北宫望的声势，萨福鼎也不甘束手待毙，一面他手下还有如宗神龙般高手，同时安排心腹石朝矶任御林军统领，以牵制北宫望。两大势力明争暗斗，各不相让。
清廷和反清的斗争已趋于白热化，双方摩拳擦掌，等待时机给予对方以沉重打击，但是任谁想不到的是双方这波对抗导火线缘起于小金川义军新一代英杰孟元超少年时的一段爱情。保定名武师杨牧之妻云紫萝原是孟元超的爱侣，由于孟元超当年卫护师门，激战大内高手而身受重伤，未能依约迎娶云紫萝。这时云紫萝怀孕，不得已嫁给了杨牧，生下了孟元超之子孟华。数年后，云紫萝获悉孟元超音讯，心生怀念，而孟元超也想要回亲生儿子，杨牧因妒生恨，设计假死，反而迫走了云紫萝。杨牧为此深恨孟元超，立意致孟于死地。
冷铁樵派出孟元超、宋腾霄、吕思美等联络各地反清力量，例如大凉山义军、江海天、金逐流两师兄弟，河北保定的天地教教主林道轩，河南红缨会的总舵主厉南星、公孙燕夫妻，关东十三家牧杨的总场主尉迟炯、祈圣因夫妻，同时物色一班愿意帮忙或愿意参加义军的少年豪杰，因此孟元超来到苏州。杨牧意图谋杀孟元超未遂，却为石朝矶所胁迫，成为大内卫士，在江湖充作朝廷耳目，同时授计让其散布流言，败坏孟元超声名。
回到中土的扶桑派成作为一股新兴的势力，被各方力量所关注甚至争取，由于来自海外，民族观念相对淡薄，除了依附于萨福鼎的宗神龙外，早期同金逐流结交的牟宗涛也逐渐为北宫望所拉拢，只余继续同金逐流保持密切来往的林无双。三派中牟宗涛势力最强，牟宗涛图谋借助北宫望力量于泰山开宗立派。
孟元超苏州先后遭遇滇南四虎和点苍双煞后，在准北大道一名“界首”的集镇上，险遭石朝矶的暗算，又受惑于石朝矶，同尉迟炯大战一场，幸好得到林无双的解围，双方冰释误会。这时尉迟炯已获知北宫望同牟宗涛暗中往来的秘密，告诫于林无双。这时杨牧已针对孟元超展开了一系列的阴谋，诬指孟元超拐带其妻子云紫萝，并邀亲戚四海神龙齐建业出面，准备在泰山扶桑派开宗大会上发难，而为联结英雄豪杰，孟元超也同林无双上泰山，云紫萝同新结识的朋友缪长风也来到泰山。
泰山大会上，围绕扶桑派掌门的宝座，各方力量开展争逐，最终掌门之位出人意料落在林无双手中，林无双任掌门同时争取了派中实力人物石卫、桑青，削弱了牟宗涛的力量，此役挫败了萨福鼎、北宫望的图谋，随后杨牧诬蔑孟元超的阴谋也遭到失败，杨牧从此声名扫地，死心塌地投靠清廷。这时的牟宗涛大为失落，而渐行渐远，终为北宫望所用。
萨福鼎派出高手，袭击天理教，擒住了副总舵主李光夏，各路英雄纷纷上京营救。北宫望巧使手段，收服杨牧，又进一步诱使牟宗涛加害孟元超，并假装营救李光夏以搏取反清侠士的尊敬，进而夺回掌门，在其引诱之下，牟宗涛彻底为其所用。尉迟炯、孟元超、缪长风等将计就计救出李光夏，收复擅长易容的李麻子，并同北宫望及手下历经数场大战，孟元超、缪长风先后同北宫望交手未分胜负，最终成功从京城脱险。
北京脱险之后，孟元超至三河县寻访云紫萝，杨牧带领大内卫士前往追杀孟元超，一番苦战，幸而宋腾霄等及时赶到，方化险为夷，云紫萝又生下一子。这时清军已大举进兵小金川，孟元超将云紫萝母子送至北芒山后，即赶回小金川安排御敌之事，路上遇唐天纵、牟宗涛等的袭杀，幸为高人所救。林无双也决意陪同孟元超一并前往小金川，而这时各路豪杰也纷纷驰援小金川。
未能当上掌门的牟宗涛和宗神龙走到一起，意图夺取掌门并加害孟元超，阴谋最终为林无双所知悉，并助孟元超成功脱险。为切断川东清军的粮道，冷铁樵亲自到达扬州，准备说服海砂帮帮主罗金鳌帮忙劫夺官粮。
在震远镖局扬州分局总镖头王元通的寿宴上，冷铁樵、孟元超等同宗神龙、杨牧、石朝矶等经一番明争暗斗，挫败了宗神龙等利用寿宴抓拿孟元超的阴谋，冷铁樵最终说服海砂帮帮主罗金鳌出手相助，不久海砂帮在扬州成功劫夺官粮。
数次交手之后，北宫望已将缪长风列为大敌，为对付缪长风，北宫望出动缪长风的师兄郝侃，协同牟宗涛和少林叛徒沙弥远暗算缪长风，幸为神秘高人所救。
缪长风继续北上，途经黄河边禹城，发现少年豪杰邵鹤年为五龙帮所擒，原来北宫望手下宝相法师密令西藏密宗拳徒张宏达暗自了帮主尤大全，控制了五龙帮大权，进而利用五龙帮对付海砂帮。张宏达并意图暗算缪长风，缪长风及时识穿了阴谋，会同厉南星救出邵鹤年和尤大全，一番激战，宝相法师脱逃，张宏达武功被废，尤大全重掌大权。
北宫望派出唐天纵、楚大雄、连甘沛至北芒山抓拿云紫萝，适逢缪长风上北芒山传报邵鹤年的音讯，段仇世上北芒山通报孟华之消息，双方一场遭遇战，最终唐天纵等败走。
泰山之上，牟宗涛、宗神龙带领一批邪派高手向林无双、石卫发难，最终一直暗助林无双的扶桑派前辈东海散人出手，挫败了牟宗涛的阴谋，牟宗涛被东海散人带走，林无双将掌门之位让给石卫，前往小金川。
缪长风、云紫萝来到大理，同北宫望派出的高手西门灼等又是数度大战，先后击杀了郝侃、沙弥远和西门灼。但是由于迟到一步，卜天雕身死，孟华落入一崆峒道士之手，却为段仇世的好友同为崆峒派高手丹丘生所救，并收为徒弟。大理事毕后，缪长风、云紫萝进入小金川助战。
清廷调动几路大军，“会袭”小金川之战即将打响，小金川义军寨距离约有百里之遥的山村一条不见行人的荒凉山路上，孟元超奉命外出巡逻，打探敌情的期间，救下了前来小金川的林无双，生擒石朝矶。
萧志远、冷铁樵从石朝矶口供中探得敌情，利用李麻子假扮韩将军，带领一支‘清兵’黑夜行军，抄小路赶到西面一个险要的山地理伏，然后通知清军统帅黄栋臣前来会师。彻底将黄栋臣大军引入圈套，小金川义军打胜了这一场大仗，清军全军覆没。
战场上孟元超受了重伤，云紫萝救了孟元超，击杀北宫望手下炎炎大师，废了连甘沛的武功.缪长风追赶北宫望，两人进行了一场生死决战，之后云紫萝、唐天纵先后赶至战场，一番生死搏杀，北宫望、唐天纵被杀，云紫萝为救缪长风牺牲自己。
北宫望死后，御林军副统领海兰察掌握了大权，继续主持对付反清侠士。陕西米脂有武林首富之称的大侠牟一行，其真正身份是义军成员，替义军经营积聚财富，接引取道米脂，前往投奔义军的各路好汉。清廷探查到真正身份，派出使毒高手韩紫烟嫁给牟一行作为继室，随后义军军饷被劫，又有好几次经牟一行指引前往投奔义军的好汉，在半路被暗杀的事情。
小金川大捷不久，位于西北的崆峒派，分为亲近义军和投靠清廷两派势力，分别以掌门人洞妙真人的得意徒弟丹丘生和洞妙真人的师弟洞玄子一家为代表，洞玄子和韩紫烟是暗中的情人关系。韩紫烟设计毒杀了牟一行后，将其女牟丽珠配予何洛。因而未来掌门的归属决定了崆峒派的立场，就清廷而言，除去丹丘生，顺利将何洛扶上掌门成为当务之急。在海兰察的主持下，导演了一幕借迎亲实施夺宝（牟一行为义军经营的财富）、杀人（丹丘生）的阴谋，所幸为牟丽珠事先获知，在丹丘生和牟丽珠的拼死救护下，挫败了海兰察的阴谋，何洛死于牟丽珠剑下，顺利将财物返还义军，但丹丘生背上了加害同门的嫌疑，被逐出师门，带领新收的徒弟孟华隐居于石林中。
嘉庆至道光年间之下篇
数年后，萨福鼎继续任大内总管，海兰察任御林军统领，欧阳业任副统领，两派继续明争暗斗，杨牧继续充当大内侍卫。欧阳业、阳继孟（孟神通之徒孙）、洞玄子联手到石林追杀丹丘生，此时适逢段仇世寻访丹丘生，一番激战，两败俱伤，洞玄子身死，阳继孟、欧阳业重任，丹丘生、段仇世为快活张所救，只余孟华继承了丹丘生衣钵，在石林苦练期间又得张丹枫留下秘笈，武功大进，出道之日即击败崆峒派剑术高手洞溟子。
清廷继续派兵进剿小金川，由崔宝山任主帅，崔宝山手下延揽了多名高手，分别称“四僧”、“四道”、“五官”，崔宝山派出多名高手混入小金川，里应外合，一举攻破小金川。为保存实力，萧志远、冷铁樵率众退入柴达木。清廷占据小金川后，开展了一系列的搜查行动，以对付义军留守人员，并残酷对待当地百姓，这时身任大内侍卫的杨牧也来到小金川。
缪长风到小金川为云紫萝上坟期间，同杨牧发生冲突，杨牧为孟华所救，却挑拨孟华向孟元超“报仇”，意图借孟华之子除去孟元超，孟华受其诱骗，对孟元超心生仇恨，孟华为救杨牧同缪长风发生误会，又为金碧漪（金逐流之女）所误解，嗣后却又联手大败崔宝山属下一众高手。
镇远镖局韩威武借运送药材到青海鄂克昭盟救灾之机会，准备暗中将部分药材送至柴达木义军驻地。此行动为清廷所疑，海兰察秘密派出尚铁宏以劫镖为名进行截杀，又暗使部下马昆、周灿沿途监视；萨福鼎则派手部下幡龙刀刘挺之和摔碑手，叶谷浑会同崔宝山部下邓中艾，乔装大盗，中途劫镖。所幸在孟华的相助下，药材顺利运抵柴达木。此时的孟华已同金碧漪冰释误会，并互生情愫，孟华至柴达木，却未能见到孟元超。
清廷在攻占小金川后，对柴达木义军继续剿杀，准备笼络回疆的几个大部落。第一步是让这些部落不要供给义军粮食，第二步是利用部落出兵攻打柴达木义军。在清廷的攻势下，萧志远只得一面放弃现在的营地，让部下化整为零，再找隐蔽的地方藏身，另一面请尉迟炯去说服各部酋长，放弃同义军的敌对行动。同时继续加强同白教法王的关系。
为削弱义军的同盟力量，清廷派出使者至西藏，意图挑动黄教来消灭白教，义军则派出孟元超至西藏，望他能够替白教和黄教作鲁仲连的，减少力量的消耗，共同对付清廷。
孟华追踪孟元超进入西藏，这时萨福鼎派出手丁兆栋扮成商队进入西藏，至拉萨的“宣抚使”衙门去送一封重要的公文。其时宣抚使名叫赵廷禄，官是文职，但赵廷禄本身却是曾经百战的将军。宣抚使之下，设有参赞武官，此人并非带兵出身的战将，武功却是极其厉害。他名叫卫托平，是大内卫士中三大高手之一。公文主要内容是要赵廷禄办三件事。第一件事情，是要他怂恿广惠法师，以护教为名，出兵青海，讨伐白教喇嘛。第二件密令卫托平，将西藏两个同冷铁樵订有盟约的部落的酋长，秘密绑架，解来京师。第三件事情是要捉拿孟元超。孟华同丁兆栋在藏边相遇，一番激战，孟华截获以上消息。
这时追赶孟华的金碧漪落入藏东场主江布之手，孟华前往营救过程中，碰上同来营救的孟元超。一番决战，关键时刻段仇世和金碧漪赶至，避免了同归于尽的悲剧，但两人均身受重伤，孟华也明白了自己的身世。
孟元超、孟华父子相认后，为破解清廷挑动黄白两教相争的阴谋，孟华替代孟元超前往拉萨布达拉宫，在藏民布吉父子的帮助下进入布达拉宫。这时赵廷禄已到布达拉宫，威迫利诱弄赞法师出兵把白教消灭，孟华及时赶到，擒下赵廷禄，救下弄赞法师，弄赞法师答应尽力化解黄白两教的宿怨。次日，孟华、金碧峰、江上云联手击败大内三大高手卫托平、叶谷浑、刘挺之和邓中艾，顺利完成了入藏的任务。
西藏事毕，孟华又奉父命至回疆驰援联络回疆部落的尉迟炯，顺便上天山探望其同母异父的弟弟杨炎。路经回疆哈萨克族的瓦纳部落，该部落首领罗海已同尉迟炯订阅盟约。之后孟华在途中受到正派叛徒段剑青（段仇世之侄儿）暗算，最终死里逃生，几番周折上了天山。这时的段剑青却先行一步混入天山，挑动天山门人围攻孟华。好不容易冰释误会又发生了天竺那烂陀寺两大神僧前来比武和清廷趁唐经天闭关之际前来偷袭，孟华会同天山派上下，联手抵御清廷高手的进攻，关键时刻唐经天开关扭转了不利局面，以上危机得以一一化解，孟华和杨炎兄弟相认，但是段剑青趁乱逃脱。
天山上，孟华知道崆峒派近日将重审其师丹丘生当年那件未了的悬案，为解丹丘生之危，孟华奉唐经天之命前往崆峒山。这时的崆峒山已然是危机重重，为收复崆峒派对付义军，海兰察欲扶植洞溟子登上掌门之位，更要消灭到会的正道高手，为此纠集了大批高手，包括欧阳业、阳继孟、辛七娘等，金碧漪和孟华先后遭暗算被擒，几番周折，方始脱险。
崆峒大会上，洞溟子欲置丹丘生于死地，不料当年相关的人纷纷出面指证，特别是牟丽珠的出现最终使到真相大白。海兰察布置的阴谋又被快活张等破解，洞溟子同洞真子同归于尽，阳继孟死于丹丘生剑下，孟华同海兰察历经一番生死决战，最终击毙海兰察，大张正派之气。丹丘生也荣任崆峒派掌门人，从此崆峒派同义军成为联盟。
这时清军已经进入回疆，准备用威胁利诱双管齐下的手段逼使回疆各族帮清廷“围袭”义军。纵然不要各族出兵，最少也要他们断绝义军的接济。义军派孟华先行去向罗海报讯，并且暂留在他那儿帮他策划抗清事宜，孟华即同金碧漪动身前往，丹丘生也追寻牟丽珠至回疆寻找这时已成为崔宝山夫人的韩紫烟报仇。
孟华赶至罗海部落，罗海严辞拒绝了清廷的胁迫，但是另一部落车居族却答应了清廷的要求。崔宝山统军进入回疆，驻扎于山谷之中。救援的义军也逐渐赶到。清军统帅崔宝山派人来下战书，声称罗海若不接受朝廷“安抚”，他的大军立即就要开来，玉石俱焚！罗海大怒之下，把崔宝山的招降书信撕粉碎，将那清军使者赶了出去。丹丘生、牟丽珠闯进大营，找韩紫烟报仇，更想刺杀崔宝山，孟华和金碧漪也联手进入大营意图刺杀崔宝山。最终功亏一篑，所幸平安脱险。快活张则趁乱烧了清军的粮草。
增援的义军同清军发生遭遇战，尉迟炯夫妇大败崔宝山手下的“四僧”、“四道”、“五官”十三高手，孟元超、孟华率军奔袭崔宝山大营，罗海也率军进攻，此战义军和罗海部小胜清军，清军被逼入山谷的一面据险固守。孟元超义释崔宝山之侄崔一伦。
新任御林军副统领诸青崖至崔宝山军中任监军，双方斗智斗力，打响了大决战，最终崔宝山大败，被围绝龙岭。为减少伤亡，孟华奉父之命进入崔宝山军中，协同崔一伦，劝说崔宝山归降。崔宝山在无路可逃情况下最终归降，诸青崖则死孟华剑下。回疆的战争结束，孟元超和参战的义军重返柴达木了。孟华的弟弟杨炎却落在一不知名的朝廷军官手中，孟华和金碧漪遍寻不获。
义军大胜之后，一晃又是七年，七年中义军扎根于柴达木，孟华、金碧漪军务之余踏遍草原找寻杨炎未获，而杨炎却已在雪山下被武林高人龙则灵所救，并传予一身本事。段剑青则在回疆一带建立自己的势力，并继续为清廷所用同义军作对。清廷方面，海兰察、禇青崖先后身死，萨福鼎年老退休，由乌苏台任大内总管，卫长青任副总管，萨天纵任御林军统领，主持对付各路抗清侠义道。杨牧继续升迁，另一身份还是震远镖局的大股东，其徒弟闵成龙任震远镖局副总镖头，暗中却是清廷卫士，师徒两人在乌苏台的支持下图谋总镖头韩威武之位，数年间又有一批贪图富贵之辈为清廷所笼络，但是也有一批抗清志士投奔柴达木义军，其中则有杨牧的三弟子方亮、四弟子范魁。
武林之中，天山派掌门唐经天仙逝，长老钟展专注于练功，唐嘉源暂摄掌门事务，候待三年守丧期满继任掌门，唐嘉源师兄石天元握有大权，但总的来说，天山派继续以义军的盟友身份，同清廷暗中作对并给予反清人士以必要的协助，依然被清廷视为眼中钉。江海天也渐步入老年，门下各弟子均在抗清斗争中扮演着重要角色，其次子江上云声名显著，游侠于江湖，热心为义军出力。金逐流已成为天下第一高手，虽未高举反清旗号，但同各路抗清领袖来往频繁，并利用其影响力相助各路反清力量。丹丘生任崆峒掌门，崆峒派呈现一派兴旺之势，但是仍有部分洞真子、洞溟子门下不服，暗中形成反对的力量，只是未敢公开。其余各大门派也均有人事更替，或盛或衰。尉迟炯夫妇继续奔出江湖，除恶扬善的同时更为义军出力。西域之中出现一股神秘的势力“白驼山”，在山主宇文博的带领下，同清廷高手相勾结，贩卖毒品“神仙丸”，在牟取高额利润的同时控制了一大批身志不坚的武林高手为其所用，以达到争霸和获利的目的。
孟华、冷冰儿、齐世杰等均在寻找杨炎，孰料杨炎艺成下山却听信奸人挑唆同孟元超、孟华发生了误会，又为冷冰儿的缘故重伤了诬蔑他们的石清泉（石天行）之子，就此同孟华、同天山派上下均反面成仇，挥剑相对，在此过程中又结识了龙则灵的外孙女龙灵珠。而冷冰儿本同齐世杰能够成就一段美好姻缘，却因其母杨大姑的阻拦不得不分手，齐世杰最终黯然随母回家，冷冰儿则是受创的心又添了一道伤口。
在柴达木的义军由于身处深山密林之中，最缺乏药物，其间靠韩威武等同情义军之人借各种机会运送了部分，但仍不够使用，于是经常性派人到外采购。某次义军派出了解洪，去北京采购药材，到了保定却为保定知府衙门的总捕头，名叫铁胆刘昆所捕捉。在其身上搜出采购药品货单，货单所列的药品，许多不是普通人所用的药品，例如防御山岚瘴气之类的药品。还有几千包行军散，解洪解释自己中贵州的药材商人，云贵两地正在发生流行的时疫，行军散是可以防时疫的。捏造了一间子虚乌有的药铺，说成是在贵州开设了近百年的老字号。恐防身怀巨款，路上万一会遭贼劫，故此药铺准备他一到京师，银两便由票号汇来。官府半信半疑，将其关押在保定衙门，并加紧调查。
义军方面则开展了营救工作，由杨牧弟子方亮、范魁来进入保定，意图通过杨牧二弟子保定大绅士岳豪出面保释，或是帮助他们暗中探监。不料岳豪暗中出卖，更由杨牧亲自出手暗算，范魁被俘，方亮带伤逃跑，请求齐世杰帮助援救范魁和解洪。
此时回家的齐世杰由于母亲的缘故曾为岳豪同尉迟炯大战一场而数日间名扬天下，成为清廷笼络收买的对象，杨牧出面招揽齐世杰成为大内卫士，或是让其继续同冷冰儿交往，以成为清廷在义军的内应，但均为齐世杰严辞拒绝。齐世杰迫于义愤出手相助，此时岳豪家中杨牧、岳豪正在迫问范魁口供。齐世杰正待出手，范魁却为来到保定的杨炎所救，随后杨炎又从牢中救出解洪，将其送往丐帮分舵。
杨炎救下了范魁、解洪之后，碰上了杨牧，杨牧故伎重演，诬蔑孟元超并让杨炎代其报仇，杨炎答应刺杀孟元超以换取杨牧脱离清廷，即赶赴柴达木。齐世杰由于身处嫌疑，同时为了向孟元超报讯也赶赴柴达木。途中杨炎再从白驼山门人手中救下了龙灵珠，同时初步探知了白驼山意图控制各大门派的阴谋。
杨炎进入柴达木，意图刺杀孟元超，一直假扮杨炎的欧阳承也抱着同一目的来到柴达木，这时的柴达木，不仅有孟元超，更有杨炎的义父缪长风。一幕假父假子之剧上演，最终缪长风向杨炎告知实情，杨炎同孟元超冰释误会。但为使杨牧脱离清廷，杨炎还是怀着龙灵珠给予的“康熙遗诏”同龙灵珠一同返回北京。
这时的北京也是“山雨欲来风满楼”，乌苏台等一直怀疑韩威武同柴达木义军有所往来，但苦于拿不到证据，因而暗中迫使韩威武退休，意图让杨牧的弟子闵成龙继任总镖头，以便彻底控制震远镖局，断了义军在京城的盟友。为不使总镖头之位落入清廷手中，韩威武只好请来杨大姑，以迫使杨牧放手，甚至让齐世杰继任总镖头。
杨炎来到京城，将密诏交予杨牧，劝其离开清廷，但杨牧表面答应，暗中却上报乌苏台，双方定下擒拿龙灵珠之毒计，所幸为杨炎所知悉，揭穿了阴谋，闵成龙受重伤无法角逐总镖头，从此杨炎认清了杨牧的真面目，但仍顾念父子之情。
义军采购药材之事在丐帮的全力帮助下，完成了采购事宜，秘密藏于秘魔崖中，筹划如何运至柴达木。
乌苏台转而扶植宇文雷任震远镖局总镖头，宇文雷击败了韩威武之女婿沐天澜，关键时刻，齐世杰、快活张、原震远镖局创始人之一戴均之孙戴京等出现，齐世杰出手击败宇文雷，快活张迫使乌苏台签下“城下之盟”，戴京继任总镖头，杨牧退出股份，彻底粉碎了乌苏台的阴谋。
在解决了震远镖局之事后，快活张假扮卫长青，凭借着夺得的腰牌，秘密将药材运出京城，同时一路由齐世杰协助押运，以确保万无一失。
这时天山派石天行安排公审杨炎，龙灵珠急上天山，途中落入宇文雷之手，石天行等又从宇文雷手中夺得龙灵珠，最终龙灵珠被江上云所救，并得到石清泉写下的“认罪服辩”。宇文雷、穆欣欣（白驼山主之妾）使毒擒住石天行，却又为孟华所救。
清廷再度对回疆用兵，首站瓦纳族首领罗海部所在的鲁特安旗。江上云、龙灵珠在往天山途中遇上段剑青和武毅带领的清军，一番激战，龙灵珠突围，江上云负伤，幸为罗海的女婿桑达儿所救。江上云嘱托桑达儿将”认罪书“交给龙灵珠，途中桑达儿却为穆欣欣所骗。围绕着“认罪书”各方展开争夺，最终为快活张巧计骗得。期间白驼山主出手同缪长风、杨炎、冷冰儿战过一场，彼此受伤。
清军进攻鲁特安旗，首战为罗海部联合天狼部和巨熊部所败，战役经过清兵主帅丁显武引淝水的战例，把雪山的峡谷比作湍急的河流，要乘敌半渡而击。作战的计划是分兵一半，由他亲自指挥，乘敌军在峡谷行进之时，强行阻击。清兵有三万之众，分兵一半已是比那两个部落的援兵多出一倍。另外一半兵力，再分成三路，两路虚张声势攻城，一路守住大营。他的如意算盘是这样打的，只须有两路兵马，陈兵城下，摇旗呐喊，已是足以吓阻城中的守军。他自己率领的那一万五千兵马，占着地利，以逸代劳，自是不难尽歼只有六七千人的敌军。由于他根本没有估计对方的士气比他旺盛，地形比他熟悉，在特殊地区的作战能力更比他高。更致命的是，他估计守军不敢冲出来，罗海偏偏就倾城而出，杀他一个措手不及。在雪山的峡谷之中，他以一倍的兵力非但占不到上风，反而只能捱打，武毅把留守的部队开上去，方能稳住阵脚。罗海分兵三路，人数和攻城的清军已是相差不远。罗海的左右两路，攻清军侧翼。清军只是虚张声势，想不到他们敢冲出来，登时乱成一团。自顾不暇，那里还能阻拦敌方的赴援部队。罗海亲自率领中路的主力部队，直趋雪山。其时武毅那一部分部队只有一半进入峡谷，沙辽率领的哈萨克骑兵，都是百中挑一的神箭手，把武毅的后军射杀死伤累累，登时给罗海切断了“尾巴”。罗海与援兵会合，里外夹击，不到半个时辰，已是杀得敌方溃不成军！罗海取得大胜，但是在黑风坳的一个哨所，却被军官尔朱荣和穆欣欣所破。
天山唐嘉源继任掌门大会，少林、崆峒、武当、青城等派高手参加庆典，崆峒掌门丹丘生身在其中。石天行推动了公审杨炎，但是在相关证人作证，加上石清泉的“认罪书”，最终杨炎无罪，重列门墙，而石清泉则因事情败露坠崖，石天行变疯。这时宇文博趁天山大会之际，协同清廷率领高手突袭天山派，打伤了长老钟展，唐嘉源、孟华先后出手同宇文博决战，最终孟华击败了宇文博，并同杨炎兄弟相认，为虎作伥多年的段剑青也为杨炎废了武功。钟展伤重而亡，唐嘉源定下了诛杀宇文博者继任掌门之令。
清军继续攻打回疆，围攻鲁特安旗长达一个月了，虽然占据了四面山头，且业已兵临城下，把这座回疆的名城围困得水泄不通，但兀是未能攻下。柴达木义军再度出动，联手抵御清兵，孟华、杨炎等已先期而至，协助罗海守城。这时卫长青和杨牧也来到军中，杨炎突出军营意图刺杀卫长青，却为杨牧所擒，卫长青逼迫并加害于杨牧，最终杨牧天良发现，临阵倒戈，协同杨炎活擒了卫长青，而杨牧也伤重而亡。这时孟元超率援军赶到，各方联手击败了清军主帅丁兆庸所部，活擒丁兆庸，清军此次用兵惨败。
数月后，孟华、杨炎、齐世杰、快活张联手大破白驼山，杨炎手刃白驼山主，成为天山派掌门。冷冰儿出家为尼，龙灵珠最终同杨炎订下了一个“七年之约”。
清末年间
此后数年，清廷内忧外患加剧，无力对柴达木和回疆用兵，义军限于实力，无力扩大胜果，活动范围囿于西北边疆地域，而各地秘密抗清力量继续发展壮大。江海天、金逐流先后身故，孟华、杨炎、金破浪虽然武功卓绝，但是面对统治近二百年的清廷，暂无力动摇其根基。白驼山死灰复燃，宇文雷继续贩卖神仙丸和向各大门派渗透。蹑云剑名家穆志遥加入御林军，由于武功高强，并策划杀害抗清义士卫承纲而升至御林军统领。武林之中各大门派继续其人事更替，根据各自的信条和利益，选择或是更亲近朝廷或是更亲近抗清力量，更多的是各自保持往来，但又不过份倒向另一边，以保证本门派继续发展。这时武林崛起一奇才齐燕然，数年间即成为公认的天下第一高手。西域地域广大，除了白驼山势力外，又有十三家联盟，公推昆仑山上官家为宗主，并以幻剑灵旗为信物，同白驼山分庭抗礼。
又十余年过去，期间又历经一场场血雨腥风，白驼山终被齐燕然徒孙卫天元和上官家传人上官飞凤等联手摧毁，同期御林军统领穆志遥也惨死西域。
期间鸦片战争爆发，洋人用大炮军舰打开了中国的大门，斗争的形势变得更为复杂起来，侠士与清廷的矛盾、侠士与洋人的矛盾、清廷与洋人的矛盾交织在一起，反清和抗洋变得并重起来。咸丰年间爆发了大平天国起义，对清廷统治形成一次打击，但由于内外原因，起义最终失败。
清廷末年，由于洋人入侵加剧，意图瓜分中国，侠士同洋人之间的矛盾成为主要矛盾，山东地区朱红灯发起义和团运动，提出了“扶清灭洋”口号，一时声势浩大，但由于义和团成份复杂，朱红灯死后，分为“反清”、“扶清”、“保清”三派，矛盾不断加剧，保清派在首领岳君雄策划下，杀害了“反清派”重要人物柳剑吟老英雄和其徒弟左含英，双方最终在北京进行了一场擂台战。“反清派”一方在柳剑吟徒弟娄无畏的带领下虽然大胜，但是擂台战尚未结束，北国联军已然打进了北京城，义和团进行抵抗，但最终失败。
在八国联军入京之后十余年，爱新觉罗皇朝（清朝）终于倒下去了。虽然跟着来的还是军阀割据，可是东方的曙光，已渐渐要透出黑暗的云幕了，抗清侠士同清廷之间的斗争也拉下了帷幕，期间付出了重大的代价，但也终于迎来了胜利的一天。 |
